1991年，附属三院成功晋级为国家三级甲等医院，成为黑龙江省西部地区首批晋级医院。2010年，附属三院率先通过黑龙江省第二周期评审验收，继续蝉联国家三级甲等医院，再次成为齐齐哈尔市首家通过的验收医院。附属三院是全国“百万妇女乳腺普查工程”定点医院，是齐齐哈尔市治疗肿瘤的专科医院, 是“神华爱心行动”齐市免费医治0-18周岁先天性心脏病患儿定点医院，是职工医疗保险、城镇医疗保险、铁路职工医疗保险、农村合作医疗定点医院,医疗助老医院、助残定点医院、评残鉴定医院。2008年，附属三院建院80周年，建筑面积3.2万平方米，功能完备的17层新门诊综合大楼正式落成竣工。作为齐齐哈尔市最大单体建筑，近9万平方米的23层新建病房综合楼，现已进入内部装饰阶段，2015年初即将交付使用。凭借科学合理的就医流程，人性化的医疗服务，绿色环保的医疗环境，成为齐齐哈尔市就医环境最优美医院。
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