首先，吴三桂起初判明降清并为清作战。后来清廷削藩才起兵反清，打出了反清复明的旗帜。最后还自已称帝。这样的人名声不太好非常正常。 洪秀全被我国历史推崇主要是因为受意识形态的影响。将他作为被封建压迫的后反抗的农民阶级代表性人物。不过现在洪秀全的名声也越来越不好。因为首先意识形态方面的原因逐步淡化， 其次，太平天国定都南京后迅速腐化 ，较之清廷有过之而无不及。
虽然后期两人作为上讲没多大区别，但两人最开始的反清动机却不一样，吴带有投机以及所在利益集团挟裹的成分，动机不纯；洪虽然后期凡有农民起义的惯病腐化严重但起义时目的明确就是反清，动机较纯粹。
所以，虽然都是反清，但洪的声誉要高点。
（PS：中立讲，如果满清入关的表现好一点，吴的声誉要好。闯王纪律和组织力还是略糟糕）
因为吴三桂后期因为利益问题与明朝决裂投靠清朝。结果等到做大面临削藩又反了结果失败身败名裂
吴三桂放清兵入关
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