A、含有本物种配子染色体的个体或由配子发育而成的个体为单倍体，由受精卵发育成的生物体不属于单倍体．A错误；B、“猫叫综合症”是由于人类第五号染色体发生部分缺失所导致，B正确；C、在减数第一次分裂后期，非同源染色体上的非等位基因之间可以发生基因重组，C正确；D、人类镰刀型细胞贫血症产生的根本原因是基因突变，D正确．故选：A．
