一是以出让的方式办理过户。
这种方式是一种买卖关系，父亲是卖方，儿子是买方，这种方式要按照交易的程序去办理。
买方主要交以下税费:契税：总售价的2％。印花税：总售价的0.05％。房屋转让手续费：500元。
卖方主要交：印花税：总售价的0.05％。房屋转让手续费：500元。
营业税：居住满一年以上者免交，未满一年者按销售价减去购入原价后的差额计征5.5％，如差额为负数，则计征数额为零。
个人所得税：一年内卖掉自有旧房购新房减免税，转让自用5年以上唯一住房免税。
二是以赠与的方式办理过户。
房产赠与应首先到公证处办理房产赠与公证手续，请向公证处咨询如何办理及费用标准（不同地方公证处收费不同，一般10万以下按300元收，10万以上按千分之三收）。之后，到房产交易中心办理房产赠与登记手续，办事程序和收费标准为：
（一）房产赠与需提交的资料
1、房屋所有权证书；
2、赠与和接受赠与公证书
3、赠与人和受赠人身份证及复印件；若受赠人为未成年人，需提交监护人身份证及复印件；
4、房屋所有权登记申请书（收件窗口领取）。
注：1、若房改房或经济适用住房赠与还需提交房改售房价格审查书、《已购公有住房上市交易申请审批表》（收件窗口领取），赠与人及共有人身份证及复印件、共有人委托书；同住成年人同意上市书面意见。
2、若有共有权人的，需提交共有权人书面证明及共有权证书。
3、若当事人不能亲自办理，需提交委托书及受委托人身份证原件及复印件。
（二）办事程序流程示意图： 收件窗口领表——收件窗口交件——契税、收费窗口交税费——发证窗口领证
（三）收费标准
1、交易手续费：双方各50％
住宅：6元/平方米。
2、登记费：由受赠方交纳
住宅：80元/套；
3、房屋所有权证书工本费：一本免费，每增加一本收10元。
4、印花税：5元/本（由受增人交纳）。
5、契税：由受赠方交纳。按房产评估额的3%－5％交纳；原来各地一般都是按照3％减半即1.5％税率征收，但在实行房产新政（6月1日）后，不少地方开始全额征收契税；房产评估额参照市场上同类房屋价格。
（四）领取房产证需携带证件
1、已交税费的发票；
2、受赠人身份证；
3、收件清单。
注：领取房证时，需产权人到场，若产权人不能到场取证，需提交委托或公证书。
商业用房哪怕是直系亲属，要加名去名，首先3%的契税是跑不掉的，然后就是去名时候的一个份额部分20%的土地增值税。
这个有详细计算公式，没有比例的。
如果是做正常买卖交易的话：营业税+个税+契税+土地增值税。一般比例是合同价的35%-45%。
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