昆南-羌塘缝合系的物质组成和构造演化相对昆仑造山带较为简单，是以晚古生代及其以后的变形为主体。基底岩系出露零星，且不同地区差异较大，主要有元古宙角闪岩相变质的苦海岩群、布伦阔勒岩群、宁多岩群等。早古生代仅在木孜塔格北黑顶山及西端以推覆岩片形式零星残留。晚古生代沉积与南部阿尼玛卿及金沙江、澜沧江等华力西期多列洋盆存在成因联系。构造变形，经历了华力西、印支两期洋陆转换，燕山、喜马拉雅期陆内造山作用叠加改造。基底岩系及古生代构造变形，已在昆仑造山带中作过论述，本节仅涉及康西瓦-木孜塔格峰-阿尼玛卿山以南的晚古生代构造混杂带和相关的地层体、沉积盆地变形特征论述。
1.晚古生代构造混杂带变形特征
板块俯冲变形、碰撞变形和后期构造叠加变形所造成的构造混杂，包括有早期基底岩系残块、板块裂解初期的残片及弧盆建造的残迹。构造混杂带部分对蛇绿岩及边界断裂已有描述，本节概略叙述晚古生代构造混杂的主体构造型式。
（1）康西瓦-木孜塔格-阿尼玛卿蛇绿构造混杂带混杂变形
受阿尔金-库牙克-康西瓦断裂截切，该带在西昆仑苏巴什以西尖灭，仅在苏巴什以东残存（见图3-4）。混杂带在西昆仑向南逆冲推覆，相伴较宽缓褶皱及间隔性板劈理，形成以石炭-二叠纪地层为主的飞来峰。东昆仑上泥盆统以牦牛山组为代表的伸展磨拉石开始裂解，石炭纪-中二叠世昆中带以北形成活动陆缘裂谷系，沿苏巴什、木孜塔格峰、阿尼玛卿一线发育有小洋盆。上二叠统格曲组与下-中二叠统马尔争组、树维门科组角度不整合接触，标志着晚古生代木孜塔格-阿尼玛卿洋盆的闭合。收缩阶段的构造混杂变形表现强烈，构造样式为不同成分、不同性质岩片的混杂堆垛，岩片之间构造接触，分隔岩片的断裂为中深-中浅层次的韧性-脆韧性剪切带（面），岩片内部也不同程度地发生韧性剪切变形，每个岩片延伸不远就被另一岩片替代。马尔争-布青山，马尔争组具透入性构造面理，该带西部构造混杂变形表现为背冲式正花状构造，东部为由南西向北东的中浅层次逆冲变形，主体为强板劈理化或网结状构造。中部树维门科一带，由南向北逆冲，不同岩片相互交织、叠置。在恩尔达可可一带为脆韧性逆冲和一系列紧闭同斜褶皱及强板劈理置换，板劈理倾向南南东，倾角30°～60°，形成强板劈理化带，使S0彻底被置换。灰岩构造透镜体普遍，总体显示中深-中浅层次脆韧性逆冲或背冲式构造变形，记录了晚二叠世的碰撞构造变形。
印支-燕山期，昆仑晚古生代构造混杂带发生脆性断裂复合，发育北西西-南东东脆性逆冲断裂构造组合，树维门科组生物灰岩推覆于格曲组之上。
（2）郭扎错-金沙江蛇绿构造混杂带混杂变形
混杂岩带组成有前寒武纪低角闪岩相宁多岩群，石炭-二叠纪基性-超基性岩，基性、中酸性火山岩，片麻状糜棱岩化中酸性侵入岩及陆缘沉积物，深海沉积碎屑岩、硅质岩、灰岩等。彼此以构造面理接触，呈规模不等的岩片（块）分布于构造混杂带中。构造变形分为四期。第一期为中深层次塑性流变，发生在前寒武纪变质岩系中，以早期片麻理、片理为主变形面，形成“W”“N”型塑性流变褶皱及深层次韧性剪切变形；从其仅发育在前寒武纪地层中，而又被主期构造所叠加，判断其形成于前泥盆纪。第二期为中深层次韧性剪切变形，为主期构造变形，不同岩块内形成透入性片理、糜棱面理，主导面理以南倾为主，右行逆冲。强变形带和弱变形域平行相间展布，强变形带内糜棱岩化、韧性变形构造群落发育；弱变形域内岩石呈薄板状、片状、透镜状，长轴方向明显交切前期的主导面理，但岩片原岩特征仍基本保留，依据变形卷入地层的时代为石炭-二叠纪，确认为二叠纪。第三期为脆性断裂叠加改造，发育南倾的逆冲断层，及轴面南倾的紧闭同斜褶皱（背形、向形）和新生轴面劈理。第四期为断面向南陡倾的剪切走滑断裂，沿断带发育透入性劈理带，劈理面上发育近水平擦痕线理，断裂旁侧发育不协调剪切褶皱。该期断裂控制了混杂岩带上叠的新生代断陷盆地。杂多县当江一带，晚更新世冲洪积物被明显切断，对破碎带断层泥进行热释光测年获得61.66 ± 6.11 ka和35.42 ± 3.31 ka年龄值，活动性明显。
（3）拜惹布错-乌兰乌拉湖蛇绿构造混杂带混杂变形
混杂带的变形和金沙江带相似，前寒武纪角闪岩相变质岩系发育在西部拜惹布错，残留早期深层次塑性流变构造。主期变形为向南逆冲叠瓦状断裂带，在乌兰乌拉带内二叠纪、三叠纪地层呈逆冲断夹块、飞来峰，混杂有二叠纪玄武岩、二叠纪台地相灰岩、辉绿岩岩墙群及二叠纪放射虫硅质岩、三叠纪若拉岗日群浊积复理石等。变形较弱的断夹块苟鲁山克错组，发育轴面北东倾斜的等厚褶皱。第三期变形是沿主期推覆断裂斜向走滑，控制混杂带内新生代上叠断陷盆地及古近纪雅西错组沉积。
（4）歇武-甘孜蛇绿构造混杂带混杂变形
仅出露在研究区东南角。玉树一带是倾向南西、向北东逆冲的叠瓦式断裂组合。北界为立新-歇武断裂，将构造混杂岩带与北侧的松潘-甘孜地块分隔，主断面产状210°∠30°，次级小褶曲指示南西盘上冲。南界为浪普断裂，其南为中甸微陆块，主断面产状195°∠52°，西南盘上冲。除上述冲断外，混杂带内零星出露早期变形遗迹，主体为韧性剪切带。
2.巴颜喀拉山盆地
巴颜喀拉山构造带，不同构造层构造变形特征各异。按变形样式和岩石组合可分为两部分。
（1）晚古生代（黄羊岭群）变形特征及主要构造样式
带内晚古生代地层黄羊岭群，西部出露面积较大，向东从银石山-布青山主要以断夹块形式出露，呈变形组合样式，主体为近东西向的褶皱-断层组合和北东向断层斜接。
近东西向褶皱，轴线呈近东西，轴面倾角70°～80°，倾向南或北，两翼产状正常，∠50°～65°，发育平行轴面的破劈理和顺层劈理，褶皱受岩石能干性控制，灰岩发育宽缓斜歪褶皱，翼部为由北向南或由南向北的逆冲断裂构造组合。粉砂岩、粉砂质板岩发育紧闭斜歪-斜卧褶皱，局部倒转或同斜褶皱。与褶皱同等发育的断裂，呈近东西向展布，是一组中间汇聚向两端发散的束状断层系，一般均发育在褶皱翼部，断面北倾，∠60°左右，断层两盘变形差异较大，北盘以发育挠曲及倾伏褶皱，南盘变形弱，产状稳定。北盘发育北北向派生断裂组，斜切黄羊岭群，派生断裂间的断夹块中发育系列派生褶皱，轴线呈北东向雁列式排列，褶皱轴线与断面的交角（锐），指示断裂具左行斜冲。
北东向断裂，主断面倾向南东，∠50°～60°，主要截切黄羊岭群，断面擦痕指向为逆冲性质。
东部银石山以东，晚古生代地层多数以断夹块产出，发育露头尺度的复杂褶皱构造，轴向总体与断夹块的构造走向一致，褶皱类型与岩石厚度和岩石能干性关系密切。中厚层灰岩褶皱转折端较圆滑，发育间隔型正扇型劈理；粉砂岩或板岩褶皱转折端呈尖棱状，轴面劈理为反扇型的连续劈理，转折端明显加厚。
阿拉克湖以东，晚古生代断夹块明显受断层控制，内部一般无褶皱，形成各种绿片岩相构造片岩，片理带宽500～1000 m，最宽达3 km。带内不同岩石呈构造岩片产出，岩片边界断裂及内部构造片理沿走向很不稳定，时而北倾，时而南倾，与断裂两侧板理倾向基本一致，∠50°以上。较大断夹块，见两期面理，早期为片理，晚期为显微尺度褶劈。沿晚期透入性面理发育韧性剪切滑动，S-C组构等显示为左旋走滑剪切。
总体变形是晚古生代断夹块在东部多以楔形体被断裂围限就位于巴颜喀拉山群之中，楔形断块沿走向在不同区段错位方向表现不同，反映楔形岩席具有半原地性质，即相当于巴颜喀拉山群的基底岩系上冲的结果。
（2）中生代-新生代变形特征及主要构造样式
中生代巴颜喀拉山群，是巴颜喀拉山三叠纪复理石单元主体，其主体变形为发育中部构造层次的褶皱及相伴的断裂构造组合，并叠加有晚期脆性及浅表层次断裂构造。
巴颜喀拉山群的褶皱构造，表现为一系列走向北西西-南东东的复式褶皱，包括正常褶皱、倒转褶皱或同斜褶皱。其中倒转褶皱或同斜褶皱主要发育在较大的走向断裂一侧，褶皱地层主要为巴颜喀拉山群二段。褶皱轴面倾向南南西或北北东，倒转翼见自南向北的层间滑脱构造，复式褶皱正常翼见南倾的逆冲推覆断层，褶皱枢纽呈波状起伏，是薄皮推覆构造的前缘褶皱。正常褶皱的轴面倾向不稳定，既有南南西倾向，也常见倾向北北东或近直立，发育在每个推覆岩片的中后部，为圆柱状褶皱，轴面劈理广泛发育，对层理常造成较强置换，特别是劈理与层理平行区段，形成强板劈理化带。劈理对层理的置换与岩性有关，变泥质岩类为叶片状板理，砂岩劈理往往呈密集的间隔劈理，组合形态为平行状或菱形网络状。受褶皱压扁作用，砂岩中钙质结核形态呈平行轴面的椭球状，Y∶Z＝1.6～1.7。
巴颜喀拉山群断裂构造，纵向以逆冲推覆为主。北西西-南东东向断裂，主体倾向北东东，∠55°～57°，断裂破碎带宽30～50 m，带中岩石破碎，挤压揉皱，脉石英、强劈理化带普遍，性质均为逆冲。这些断裂，部分在新构造活动中再次复活，断裂明显切断第四纪沉积物，沿断裂有断层泉、洼地分布，活断层运动性质主要为左行走滑，形成拉分式陷落地貌，并控制古近纪及新近纪断陷盆地。
3.北羌塘-唐古拉地块变形特征及主要构造样式
（1）甜水海地块变形特征及主要构造样式
甜水海陆块结晶基底布伦阔勒岩群变质岩系，变质程度不均匀，变质相系不连续，但主体以高角闪岩相为主，其原始层理已基本被置换殆尽，主变形面为片（麻）理，早期表现为露头尺度的顺层掩卧褶皱、片内无根褶皱、紧闭尖棱褶皱及顺层的韧性剪切带，形成新生构造面理-流劈理、新生片理，显示了中深构造层次的分层剪切流变变形，是前期变形的残留构造。晚古生代为挤压构造变形，以片理为变形面的宽缓褶皱和新生面理-褶劈理。
中新元古界浅变质陆源碎屑-碳酸盐岩和下古生界，在晚古生代时期经历近南北向挤压，褶皱样式为轴面近直立的等厚褶皱、同斜褶皱及与剪切作用相关的倾竖褶皱。
断裂构造主要为叠瓦状韧脆性逆冲推覆断裂，由北向南呈叠瓦扇状推覆。
（2）杂多-开心岭晚古生代地层的变形特征及主要构造样式
该带前寒武基底岩块，主要为角闪岩相变质岩，呈残块断续出露。发育深层次塑性流变、各种不对称流变褶皱、无根褶皱、石香肠等，反映深层次韧性剪切流变特征，是前期变形的残留构造。
石炭-二叠系发育宽缓等厚褶皱、不对称褶皱，轴面倾向北西，等厚褶皱轴面直立，核部劈理不发育。同斜褶皱轴面倾向南西，发育间隔性破劈理；受岩石能干性控制，变形样式有差异，能干性较弱的板岩和薄层粉砂岩，翼间发育不协调褶皱，砂岩夹层则透镜化，或呈颈缩式石香肠。能干性强的中厚层砂岩、灰岩，形成宽缓等厚褶皱，而在碎屑岩和块状灰岩接触部位，碎屑岩形成复杂不对称褶皱。
（3）中生代-新生代变形特征及主要构造样式
中生代地层以中上三叠统为主体，并有上叠盆地侏罗系、白垩系。
结扎褶冲带，连续发育不协调同斜褶皱，走向北西，轴面倾向南西，枢纽平直。断裂与褶皱等同发育，一般为断面南倾的逆冲断层，断裂影响强烈地段，褶皱枢纽倾伏，形成倾伏同斜褶皱。巴塘群褶皱轴走向北西，轴面直立，以等厚褶皱为主体，轴面劈理不发育，一般为短轴褶皱，不同岩性层交替带，软弱岩层发育露头尺度不协调褶皱。
侏罗系雁石坪群，发育轴面倾向北西的等厚短轴背、向斜，轴面直立，枢纽平直，核部及翼部劈理不发育。
白垩系风火山群，主要以挤压型挠曲及剖面上对冲前展式组合为主要变形样式。
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