建议考外科的研究生,毕竟那样才是你本专业的提升。如果考内科,毕业出来就是注册内科医师了。你考上内科的研究生后可以到卫生局申请变更执业方向,这样利于你研究生期间在医院内科实践。
报名考试→通过考试→通过复试→体检→录取→申请辞职→学校报到→学校学习理论1年→医院实践2年(相当于工作)→毕业→找工作→定专业。
如果你仅仅是因为你工作单位有意见,则无需改专业方向,研究生毕业了换个单位就是了,如果是真的不想做外科换专业方向到是可以。
最后奉劝一句,你在这个单位不适应,换了一个单位未必就好。放平心态,找好考研的目的。