根据《国家税务总局关于调整个人取得全年一次性奖金等计算征收个人所得税方法问题的通知》（国税发[2005]9号）规定，应先将纳税人当月内取得的全年一次性奖金，除以12个月，按其商数对应的个人所得税税率表确定适用税率和速算扣除数。如果纳税人当月取得工资收入低于税法规定的费用扣除额，应将全年一次性奖金减除“雇员当月工资薪金所得与费用扣除额的差额”后的余额，按上述办法确定全年一次性奖金的适用税率和速算扣除数。
40000/12=3333.33,适用15%档税率，税率15%，速算扣除数为125，
应缴个税40000*15%-125=5875元
年终奖缴纳个税计算公式（1）个人取得全年一次性奖金且获取奖金当月个人的工资所得高于（或等于）税法规定的费用扣除额的。
计算方法是：用全年一次性奖金总额除以12个月，按其商数对照工资、薪金所得项目税率表，确定适用税率和对应的速算扣除数，计算缴纳个人所得税。
计算公式为：
应纳个人所得税税额=个人当月取得的全年一次性奖金×适用税率-速算扣除数
个人当月工资、薪金所得与全年一次性奖金应分别计算缴纳个人所得税。
（2）个人取得全年一次性奖金且获取奖金当月个人的工资、薪金所得低于税法规定的
费用扣除额的。
计算方法是：用全年一次性奖金减去“个人当月工资、薪金所得与费用扣除额的差额”后的余额除以12个月，按其商数对照工资、薪金所得项目税率表，确定适用税率和对应的速算扣除数，计算缴纳个人所得税。
计算公式为：
应纳个人所得税税额=(个人当月取得全年一次性奖金-个人当月工资、薪金所得与费用扣除额的差额)×适用税率-速算扣除数。 由于上述计算纳税方法是一种优惠办法，在一个纳税年度内，对每一个人，该计算纳税办法只允许采用一次。对于全年考核，分次发放奖金的，该办法也只能采用一次。工资、薪金所得，以每月收入额减除费用2000元后的余额，为应纳税所得额。
级数
全月应纳税所得额（含税所得额）
税率%
速算扣除数（元）
一
不超过500元
5
0
二
超过500元至2000元
10
25
三
超过2000元至5000元
15
125
四
超过5000元至20000元
20
375
五
超过20000元至40000元
25
1375
六
超过40000元至60000元
30
3375
七
超过60000元至80000元
35
6375
八
超过80
000元至100000元
40
10375
九
超过100000元
45
15375
股息、红利所得，以每次收入额为应纳税所得额。税率20%.
这还真没遇到过呢
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