正确的选择C。
解析：
选项A错误，流经城市生态系统的总能量包括了城市生态系统中的生产者固定的太阳能以及从外围的农田生态系统等补偿输入的能量，故该选项错误。
选项B错误，从植食动物传递给肉食动物的能量为（14+2-4-9-0.5）×1000=2.5×1000，而肉食动物消化吸收的总能量为（2.1+5.1+0.05+0.25）×1000=7.5×1000，故外界输入的是5×1000，故错误。
选项C正确，流经该生态系统的总能量是（23+70++3+14+2+5+12）×1000=129×1000.故正确。
选项D错误，从图解中看，从第一营养级到第二营养级的能量传递效率并没受到人为影响有改变，仍然是14÷（23+70+3+14）=12.7%，而不能认为是16÷110=14.7%，故该选项错误。
能量从第一营养级（生产者）到第二营养级（植食动物）不能加上2，因为这个2不是第一营养级给第二营养级的；
而第二营养级（植食动物）到第三营养级（肉食动物）要加上2，但不加5，因为这个5是人给第三营养级的。
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