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简单来讲，社保有五种保险，新农合只是医疗保险。
缴费标准不同：社保因为有五险，缴费比新农合高许多，如果说新农合200元，那么社保缴费就1000元。
报销比例不同：社保中的医保，主要是用于看病报销，包含住院医疗费报销生育补助以及普通门诊等统筹医疗费的报销;新农合用的地区不同报销比例也是不同的。
使用范围：社保中的医保，可用于挂号、看病就医、药店买药以及住院报销等;新农合在多个城市只有住院才能报销，极少城市看病就诊可报销。
参保范围不同：社保只要有正式工作都可以参保，而新农合需要农村户口才可以办理。
参保年限不同：社保按月缴纳，如果中间出现断交行为就无法报销，参保累计达到15年，退休后可以领取退休金，参保男性满25年，女性满20年，退休可以享受医疗报销待遇;新农合是一年一交，保障一年。
有以下两点区别：
1、缴费标准不同。
要知道新农合一年的缴纳费用也就在两百元左右，而社保的话一年最低也要缴纳一千元。如果你的工资高的话，需要缴纳的金额也越高，所以从缴费标准来看，社保比新农合要高不少。一般对于有稳定工作的人而言，他们有固定的收入，固定的缴费金额对他们而言是没问题的，但对于大多数没有工作的农民来说，显然选择新农合更为划算，除非他有长期的工作情况下，那么选择社保更合适不过了。
2、报销比例不同
社保中的报销主要是看病报销，其中包括住院医疗费用报销，普通门诊报销等等；而新农合，对于不同的地区，也有不同的报销比例，门诊报销要比社保范围大，而且还有大病报销。
至于哪个报销比例高，这取决于你是在乡镇医院还是市级医院，在乡镇医院的话，新农合报销会更划算；如果在市级医院及以上医院治疗，社保的报销比例会更高。
值得注意的是，医院级别越高，报销比例会明显降低，在这方面，新农合和社保都是一样的。
一般来说，社保报销比例一般在70%～85%之间，新农合报销比例在50%～70%之间。具体会因政策和地区而稍有不同。
拓展阅读：《社保的最新解析，到底有什么用途？》
1、保障人群不同
城乡居民医疗保险的保障对象是没有工作的居民，和没有参加城镇职工医疗保险的城镇未成年人；
新农合的保障对象主要就是农村农民。
2、保障力度不同
城乡居民医疗保险的起付线，比新农合高，在大医院的报销比例也比新农合高；而新农合在乡镇卫生院的报销费用就比较高；
城乡居民医疗报销的缴费是每个月都要交，最高可以报销70%，新农合是一年交一次，最高报销30%。
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3、是管理的部门不同
城镇居民医保主要由人社部门管理，新农合多数地方由卫生部门管理。
4、是保障待遇的侧重点不同
城镇居民医保主要保住院和门诊大病兼顾普通门诊，所以住院及门诊大病待遇都要高于新农合。新农合的门诊待遇水平要高于城镇居民医保。
参考资料来源：
/baike.baidu.com/item/医保"target="_blank"title="百度百科-医保">百度百科-医保
/baike.baidu.com/item/新型农村合作医疗?fromtitle=新农合&fromid=1616836"target="_blank"title="百度百科-新型农村合作医疗">百度百科-新型农村合作医疗
农村医保和社保的区别在缴纳费用、包含项目和缴费方式。 缴纳费用不同：相比之下农村医保的费用低很多； 包含项目不同：社保除了包含医保还包括养老、失业、工伤和生育保险；农村医保是由参保人负担全部费用，而社保是由职工和公司一起承担费用的。
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