不知道贵公司正在讨论，还写信打扰，不好意思。那就请你们继续（为我们）讨论一下（哪个方案比较好）
贵社で検讨していることが存じなくて、
不知道贵公司正在讨论
ご迷惑を挂けしました，申し訳ございません。
还写信打扰， 不好意思（这里我用的是，打扰到贵方，非常的抱歉----体现郑重一点）
PS:直接说打扰了非常不好意思就好了，不需要重申你打扰对方的手段。
（どちらの案が良いか）引き続き検讨をお愿い致します。
（那种方案比较好） 那还请拜托贵方继续讨论一下。
整段话
贵社内で検讨をなさっていることを存じませんでした、ご迷惑を挂けしました，申し訳ございません。引き続きご検讨をお愿い致します。
以上全部都是手工翻译，确保精度。用的好请采纳哟。
手纸を书きまして、申し訳ありません、御社が议论していることが存じませんでした。
これからもまた方案の方をお愿いいたします。
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