危害西瓜的主要病害有猝倒病、立枯病、锈根病(上述三病可用恶霉灵、铜铵合剂、百菌清、敌克松防治)、炭疽病(苯醚甲环唑、咪鲜胺等)、枯萎病(80%恶霉灵·福美双、50%代森铵、70%敌克松等)、病毒病(盐酸吗啉胍、氨基寡糖素等)、白粉病(绿妃、三唑酮)、疫病(70%烯酰·嘧菌酯等)、蔓枯病(绿亨一号、托布津、代森锌等)等。