鹦鹉热衣原体是自然性疫源，可再哺乳动物之间传播。鸟类多为隐性持续感染，甚至终生携带。当鸟长途飞行导致过度疲劳或营养不良等因素降低机体免疫力时，可感染发病或死亡。哺乳动物可通过垂直、蚊虫叮咬和粪口等途径传播。
