医院设有53个临床和医技科室，为省内科室齐全的综合性医疗机构。拥有器官移植、肝胆胰、中西医结合、烧伤、亚低温治疗、康复医学6个省级研究中心；烧伤科、肝胆胰外科、泌尿外科、皮肤科、骨科、眼科6个云南省临床重点专科；冠心病基础、脑血管疾病、泌尿外科、红斑狼疮、护理学5个省级研究室；肝胆胰、烧伤、泌尿、微创、器官移植、危重医学、康复医学等学科步入了国内、省内领先行列；是国家药物临床试验基地（包括10个专业）、云南省化学中毒救治基地及住院医师规范化培训基地。
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