1、质粒中标记基因的作用是有利于对目的基因是否导入进行检测。2、重组质粒上的标记基因的作用是鉴别受体细胞中是否含有目的基因，从而将含有目的基因的细胞筛选出来。
质粒和重组质粒中的标记基因主要是用于筛选，一般选择抗性基因来作为标记基因，这样就可以在相应的抗性培养基中生长，达到筛选目的
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