在PCR体系中怎样精确确定引物退火时间?

2025-03-20 11:28:35
推荐回答(4个)
回答1:

在PCR体系中精确确定引物退火时间的公式为:
1、当引物长度低于20个bp可以根据Tm=3GC+2AT
2、对于更长的寡聚核苷酸,Tm计算公式为:

Tm = 81.5 + 16.6 x Log10 + 0.41 (%GC) – 600/size
公式中,Tm表示退火时间,Size = 引物长度。

退火,主要是指将材料曝露于高温一段很长时间后,然后再慢慢冷却的热处理制程。主要目的是:(1)释放应力,(2)增加材料延展性和韧性,(3)产生特殊显微结构。

PCR(聚合酶链式反应)是利用DNA在体外摄氏95°高温时变性会变成单链,低温(经常是60°C左右)时引物与单链按碱基互补配对的原则结合,再调温度至DNA聚合酶最适反应温度(72°C左右),DNA聚合酶沿着磷酸到五碳糖(5'-3')的方向合成互补链。基于聚合酶制造的PCR仪实际就是一个温控设备,能在变性温度,复性温度,延伸温度之间很好地进行控制。

回答2:

退火时间是非常次要的,我25s也做过,45s也做过,并没有什么区别。引物如果18-25bp的话,30s是足够的了。比起退火温度来,退火时间实在不算是决定因素~

回答3:

哈哈,反复做实验,找到最佳时间!

回答4:

Tm是退火温度,不是退火时间呀!