看看你的配置是否正确，这种情况应该不会出现的，字幕是镶嵌的，看看是否有裁剪画面，如图给你一个默认的你比较一下
格式工厂这软件不是很好 建议你还是换一个吧 比如用MEDIACODER或者WOLI转换器也行
一:你没选好转换选向 二:你没注册....
用超级转霸就好了，，不用格式工厂
原先的视频格式不规范
暴风转码
