支付进出口佣金如何纳税?

对境外支付的佣金、设计费、技术服务费、会员费等事项，有代扣相关税金义务。

营业税：
①《中华人民共和国营业税暂行条例》第一条“在中华人民共和国境内提供本条例规定的劳务、转让无形资产或者销售不动产的单位和个人，为营业税的纳税人，应当依照本条例缴纳营业税。”
②《中华人民共和国营业税暂行条例实施细则》第四条“条例第一条所称在中华人民共和国境内（以下简称境内）提供条例规定的劳务、转让无形资产或者销售不动产，是指：（一）提供或者接受条例规定劳务的单位或者个人在境内；”
③《中华人民共和国营业税暂行条例》第十一条“营业税扣缴义务人：（一）中华人民共和国境外的单位或者个人在境内提供应税劳务、转让无形资产或者销售不动产，在境内未设有经营机构的，以其境内代理人为扣缴义务人；在境内没有代理人的，以受让方或者购买方为扣缴义务人。”
④另外《中华人民共和国营业税暂行条例实施细则》规定“第十条 除本细则第十一条和第十二条的规定外，负有营业税纳税义务的单位为发生应税行为并收取货币、货物或者其他经济利益的单位，但不包括单位依法不需要办理税务登记的内设机构。”

根据上述①②③规定，付给境外公司的佣金等费用，无论该劳务发生地是在境内还是境外，但都属于劳务提供，接受劳务方在境内，应代扣该劳务的营业税。
根据上述④规定，境外企业负有营业税纳税义务，也就是说税金应该是由境外公司承担。出口企业有代扣税金的义务。