可以直接到当地工商分局登记注册，对养殖合作社国家免收注册登记费。 其中， 要求成员最低 5 人以上，其中农民成员占 80%，如果成员比较多， 可以由乡镇农经站统一开成员身份证明。 要注册养殖专业合作社，要涉及环评 、卫生许可等前置审批。具体情况，需要养殖户直接到当地工商局咨询。
据了解，如果打算办养猪合作社要根依据《农村专业合作社章程》办理，为此本刊摘录部分内容予以刊登。
同时《农村养猪专业合作社建设参考》一文对养殖户也有些很好的建议可以参考。
农村专业合作社章程
第二章 设立和登记
第十条 设立农民专业合作社，应当具备下列条件：
（一）有五名以上符合本法第十四条、第十五条规定的成员；
（ 二 ） 有符合本法规定的章程；
（三）有符合本法规定的组织机构；
（ 四 ） 有符合法律 、 行政法规规定的名称和章程确定的住所；
（五）有符合章程规定的成员出资。
第十一条 设立农民专业合作社应当召开由全体设立人参加的设立大会。 设立时自愿成为该社成员的人为设立人。设立大会行使下列职权：
（一）通过本社章程，章程应当由全体设立人一致通过；
（二）选举产生理事长 、理事 、执行监事或者监事会成员；
（三）审议其他重大事项。
第十二条 农民专业合作社章程应当载明下列事项：
（一）名称和住所；
（二）业务范围；
（ 三 ） 成员资格及入社 、 退社和除名；
（四）成员的权利和义务；
（ 五 ） 组织机构及其产生办法、职权、任期、议事规则；
（ 六 ） 成员的出资方式 、 出资额；
（七） 财务管理和盈余分配 、亏损处理；
（八）章程修改程序；
（九）解散事由和清算办法；
（十）公告事项及发布方式；
（ 十一 ） 需要规定的其他事项。
第十三条 设立农民专业合作社，应当向工商行政管理部门提交下列文件，申请设立登记：
（一）登记申请书；
（二）全体设立人签名、盖章的设立大会纪要；
（三）全体设立人签名、盖章的章程；
（四）法定代表人、理事的任职 文 件 及 身 份 证明；
（五 ）出资成员签名、盖章的出资清单；
（六 ）住所使用证明；
（ 七 ） 法律 、 行政法规规定的其他文件。登记机关应当自受理登记申请之日起二十日内办理完毕， 向符合登记条件的申请者颁发营业执照。农民专业合作社法定登记事项变更的，应当申请变更登记。农民专业合作社登记办法由国务院规定。 办理登记不得收取费用。
第三章 成 员
第十四条 具有民事行为能力的公民， 以及从事与农民专业合作社业务直接有关的生产经营活动的企业、 事业单位或者社会团体， 能够利用农民专业合作社提供的服务，承认并遵守农民专业合作社章程， 履行章程规定的入社手续的，可以成为农民专业合作社的成员。但是，具有管理公共事务职能的单位不得加入农民专业合作社。农民专业合作社应当置备成员名册，并报登记机关。第十五条 农民专业合作社的成员中， 农民至少应当占成员总数的百分之八十。成员总数二十人以下的，可以有一个企业、事业单位或者社会团体成员； 成员总数超过二十人的，企业、事业单位和社会团体成员不得超过成员总数的百分之五。
农村养猪专业合作社建设参考
在合作社登记设立阶段，应着重抓好三个建设：
（一）组织机构建设。 《农民专业合作社法》第四章，对合作社组织机构的成立、职权、职责以及成员大会等均作了明确的界定， 成员（代表）大会是合作社的最高权力机构，理事会是执行机构，监事会是监督机构。 在组织机构建设上，要突出做好以下四项工作：
一是组建一个过得硬的理事会。
二是选配一名高素质的理事长。
三是选聘一名业务精的财会人员。 合作社是一个经济组织，离不开财务核算。 所以农民专业合作社必须聘请具有专业资格的财会人员。在合作社创办的起步阶段，如果没有合适的专业财会人员， 可聘请当地村级组织的报帐员担任，也可以委托乡镇财务核算中心代理做帐。
四是合理设置内部机构。合作社在内部机构设置上， 要根据每个合作社实际需要合理设置。对于一些较大型的合作社，可设置办公室、财务室、技术（供应）服务部、市场营销部等机构
这个跟农民专业合作社的手续一样
首先，需要5个以上的首批合作社成员的身份证复印件，还有合作社章程，住所使用证明，出资清单，理事长和监事会等任职文件，最后就是，到工商局要一份申请登记表
打你当地畜牧局问一下，我们这里养牛养羊的很多，合作社也有几个，到畜牧局办理检疫证就可以了，然后再到工商局办理营业执照。
畜牧局备案，办养殖证，卫生局办免疫证
每个地方要的不一样咨询下畜牧就OK了
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