广深高速公路由于途径广州和深圳两个有千万人口的城市，以及被称为“世界工厂”的东莞，车流量极大，被称为“中国最赚钱的高速公路”，交通堵塞经常发生。还曾因原来的服务区被拆除，百余公里的高速公路没有服务区而惹官非。2012年6月1日，广深高速费用部分下调：
原标准：一类车：70 元；二类车145元；三类车 220元；四类车 275 元；五类车300 元
调整后标准：一类车：74 元；二类车111元；三类车 147元；四类车 221 元；五类车258 元
2012年12月1日，根据“就低不就高”的原则，广深高速公路通行费再次下调：
最新标准：一类车：70 元；二类车111元；三类车 147元；四类车 221 元；五类车258 元。
维修
从2008年至今，广深高速公路由于长期超载，每年都进行维修，每年的维修费用为4-8亿元。
“费坚强”
2013年1月27日，不少广东省人大代表呼吁取消广深高速收费，认为长年收费已不合理。从2003年有代表开腔质疑，到2012年12月，在多方呼吁下，广深高速终于比原来的72块减了2块钱。但深圳代表团林慧说，这样的降价幅度让他们很郁闷，而且广深高速路况差，通行慢，投资商早就收回成本。为此，她送了广深高速一个外号叫——“费坚强”。
“可以说，广州、深圳所有老百姓，都会为广深高速这条路头痛。除了晚上11点以后到凌晨之间不塞车，其余时间基本上都堵。”林慧说，两会都在强调要加强广深合作，但仅仅150公里的路程，两三个小时还不一定能到，出行让人非常痛苦。让她更郁闷的是，广深高速路况不好、收费还高。
“深圳代表团2003年就有代表呼吁降价，我从2007年起每年也都呼吁，记得当时是72元，后来变成了70元。”林慧回忆到，2012年年中全省高速公路减免收费，当时以为广深高速要降价了，结果大车降、小车升至74元。“小车占广深高速70%车流量，不降反升！真的很郁闷。去年12月再次调整，才降为70元。”
“10年呼吁，才降了2元，而路是更颠簸不平了。”她说，本来没打算提广深高速降价方面的议案，但呼吁10年却只降了2元，让人实在很郁闷。“其实我也不想穷追猛打，但广深高速怎么能让人满意，天天开车，它就摆在面前。”
“我的要求也不高，就希望降到按国家标准来收，0.45元一公里，四十几元全程。” 她说，一定会把这件事呼吁下去，也算为百姓办件事。当她说到动情处，深圳代表团刘林代表举手说：“我支持你！”
“高速公路属于公共基础设施，不应是暴利行业。”林慧还指出，高速公路利润回报率和年限一定都要有限定，“广深高速问题一天不解决，老百姓对广东交通系统就不会满意。”
28日，广东省交通厅厅长曾兆庚表示，由于程序和资金的问题，广深高速短期内不会取消收费。他还透露，广东高速公路建设存在融资难的困难，十二五期间，建设资金缺口达400亿还为解决。
广深高速公路由香港合和实业子公司合和公路基建有限公司投资兴建，于1997年通车，有三十年专营权直至2027年。
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