一、两者的工作原理不同：
1、四冲程柴油发动机的工作原理：每个工作循环也是由进气行程、压缩行程、做功行程和排气行程组成。由于柴油机以柴油作燃料，与汽油相比，柴油自燃温度低、黏度大不易蒸发，因而柴油机采用压缩终点自燃着火，其工作过程及系统结构与汽油机有所不同。
2、汽油机发动机的工作原理：转化过程实际上就是工作循环的过程，简单来说就是是通过燃烧气缸内的燃料，产生动能，驱动发动机气缸内的活塞往复的运动，由此带动连在活塞上的连杆和与连杆相连的曲柄，围绕曲轴中心作往复的圆周运动，而输出动力的。
二、两者的使用不同：
1、四冲程柴油发动机的使用：广泛应用于交通运输机械、农业机械、工程机械和发电机组等各个方面。
2、汽油机发动机的使用：由于在相同功率条件下，汽油机的尺寸与质量都较柴油机小；转矩特性好，启动和加速性能较好，运转噪声较低，制造成本较低，因而汽油机的用途很广，在飞机、汽车、快艇、赛车、小型农机、园林机械甚至航模等都大量采用。
三、两者的特点不同：
1、四冲程柴油发动机的特点：四冲程柴油机在一个工作循环的四个活塞冲程中，只有一个行程是做功的，其余三个行程是做功的辅助行程。
2、汽油机发动机的特点：由于汽油黏性小，蒸发快，可以在气缸外部与空气形成均匀的混合气，然后将混合气吸入气缸，或用汽油喷射系统将汽油喷入气缸，使气体膨胀做功。汽油机的缺点是热效率低于柴油机，泊耗较高，点火系统比柴油机复杂，可靠性和维修的方便性也不如柴油机。
参考资料来源：百度百科-汽油发动机
参考资料来源：百度百科-四冲程柴油机