A、孟德尔所作假设的核心内容是“性状是由遗传因子控制的”,孟德尔所在的年代还没有“基因”一词,A错误;B、孟德尔并没有提出等位基因的说法,他所在的年代还没有“基因”一词,B错误;C、测交实验是对推理过程及结果进行的检验,为了验证作出的假设是否正确,孟德尔设计并完成了测交实验,并有效验证了分离定律的实质,C正确;D、孟德尔的自由组合定律是发生于减数分裂过程中,D错误.故选:C.