一、特点不同
1、真石漆：适用面广、水性环保、耐污性好、使用寿命长、经济实惠、无安全隐患。
2、水包水：具有耐磨损，冲刷与紫外线照射、抗静电、耐高温、耐酸雨、防水、防龟裂、高强度、耐长期多种气候条件变化的特性，性能保持不变，易于保养和清洗、自洁性优异、多色彩一次喷涂、施工容易、是一种绝佳耐水性、耐候性、只涂装材料。
二、性质制作不同
1、真石漆：主要采用各种颜色的天然石粉配制而成。
2、水包水：是一种水性乳胶涂料的分散水相,是保护胶水溶液构成的连续相的多相悬浮体。
三、应用不同
1、真石漆：适合于各类建筑物的室内外装修。特别是在曲面建筑物上装饰，生动逼真，有一种回归自然的效果。由于真石漆具备良好的附着力和耐冻融性能，因此适合在寒冷地区使用。
2、水包水：适用于高层建筑、楼堂馆所、公寓豪宅（豪宅装修效果图）等建筑外墙，是实现花岗岩豪华装修效果，施工又特别简易的高级饰面材料；适用于园林雕塑、塑像模特、建筑廊柱、彩色围栏等工艺制品表层的高档美化装饰，轻松赋予极佳的典雅岩石风采。
参考资料来源：
百度百科-水包水多彩涂料
百度百科-真石漆