氢键：
化学角度：氢原子与电负性大、半径小的原子X(氟、氧、氮等)以共价键结合，若与电负性大的原子Y(与X相同的也可以)接近，在X与Y之间以氢为媒介，生成X-H…Y形式的一种特殊的分子间或分子内相互作用，称为氢键。[X与Y可以是同一种类分子，如水分子之间的氢键;也可以是不同种类分子，如一水合氨分子(NH3·H2O)之间的氢键]
生物角度：一条DNA分子中的两条单链通过氢键相连接
磷酸二酯键：一种化学基团，指一分子磷酸与两个醇（羟基）酯化形成的两个酯键。该酯键成了两个醇之间的桥梁。例如一个核苷的3ˊ羟基与别一个核苷的5ˊ羟基与同一分子磷酸酯化，就形成了一个磷酸二酯键。
区分：DNA分子中碱基对AT（U），CG之间用氢键链接，
两个相邻的核苷酸之间用磷酸二酯键连接的。连接的是上一个的磷酸基团和下一个的五碳糖。
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