应该做意外损失处理，同时归集有关证明资料进行报批，并作相应税务处理。
比如：将委托加工材料转入到待处理资产损益-待处理流动资产损益，残料收回的，根据形态计入原材料或其他资产科目，应有加工单位或保险公司赔偿的，计入相关科目，还有其他损失的，报批后做入营业外支出，有进项税的，应该做进项税转出。
按实际收回的数量计入原材料或库存商品，等于是本批次产品单位成本提高了。
例如，委托加工产品100件，每件成本20元，加工费每件5元；收回98件，2件报废
发出时
借：委托加工材料 2000
贷：原材料 2000
发生的加工费
借：委托加工材料 500 （进项税略）
贷：银行存款 等 500
收回98件
借：原材料 / 库存商品 2500
贷：委托加工材料 2500
如果报废2件，每件成本=2500/98=25.51
如果没有废品，每件成本=2500/100=25
在加工收回时，即：借：原材料（实际加工收回的材料），借：营业外支出（报废的数），贷：委托加工物资（原付出数）、贷：银行存款-----加工费
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