基因型是Yyrr的植物自交，根据分离定律：先看第一对基因Yy×Yy，其后代性状分离比应为显性：隐性=3：1；第二对基因为rr，为隐性纯合，自交后代全为隐性性状，不发生性状分离；故基因型是Yyrr的植物自交后代分离比为3：1．故选：A．
