该大学重点学科、优势专业有:
（一）一级学科国家重点学科
生物学
工商管理
（二）二级学科国家重点学科
逻辑学
中国古代文学
基础数学
人文地理学
神经病学
肿瘤学
马克思主义哲学
英语语言文学
凝聚态物理
药理学
外科学（普外）
卫生毒理学
人类学
中国古代史
无机化学
内科学（内分泌与代谢病）
眼科学
行政管理
思想政治教育
中国近现代史
高分子化学与物理
内科学（肾病）
耳鼻咽喉科学
（三）国家重点（培育）学科
中国哲学
地图学与地理信息系统
社会学
病原生物学
马克思主义基本原理
光学
（四）国家级特色专业（19个）
法医学
工商管理
汉语言文学
行政管理
护理学
化学
会计学
历史学
临床医学
人类学
软件工程
生物技术
生物科学
数学与应用数学
网络工程
微电子学
预防医学
哲学
资源环境与城乡规划管理
中山大学有国家高等学校特色专业建设点19个。国家级专业综合改革试点项目17个。
优势专业有
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