FBI是隶属于美国司法部的，是一个公开的执法机构，同时FBI也负责国内的反恐和反间谍工作。FBI因为是公开的，所以执行任务都要依照联邦法律。你可以理解FBI是高级一点的警察。
CIA是隶属于国防部的，是军方的机构，其实直接听命于总统。CIA是一个纯间谍机关，按照美国的法律，CIA是不能在美国国内行动的，只能在国外行动。CIA要监视国外恐怖分子的动向、搜集各种军事情报、搞暗杀搞颠覆，总之就是秘密的做一些有利于美国的事。
也就是说在美国国内如果有人跟你说他是CIA，你可以不配合他因为CIA不能在国内行动，但如果他说是FBI你就得乖乖配合了。
所以说CIA和FBI是两个不相关的机构，一个负责国外一个负责国内，不过也有合作就是了。
前者对外，后者对内
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