没有关系的，拆迁主要是以房产证确认产权和赔偿面积，相关法律法规也有约定“地随房走”：
《中华人民共和国房地产管理法》第三十二条规定：房地产转让、抵押时，房屋的所有权和该房屋占用范围内的土地使用权同时转让、抵押；
《担保法》第36条中也规定：以依法取得的国有土地上的房屋抵押的，该房屋占用范围内的国有土地使用权同时抵押；
《物权法》第182条第1款规定：以建筑物抵押的，该建筑物占用范围内的建设用地使用权一并抵押。
你的这套手续值得商榷，你不是本集体经济组织的成员，不能享受该村的宅基地，土地证涉嫌骗取批准，房产证是根据土地证和准建手续办理的，房产证怎么是你舅舅的名字呢？
土地证只是使用权利.房产证是占有权利.所以建议还是把该补的款项补齐再说!
没有接触过相类似的。。
不过问一句，难道不可以把房产证过户给土地使用权人吗？这样就都是你的名下了。
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