暗野显微镜（暗场显微镜）并不是“分辨率0.004~0.2μm”，而是能观测到0.004~0.2μm的微粒存在。
暗野显微镜的原理很简单，就是把视野亮度压低（选择透明度高的悬浊液和侧光照明），使极小的颗粒散射的光线像夜空中的星星一样被观察到。你的计算没有错，6.4微米的线大小确实比人眼能分辨的100微米线大小低了20倍，但它散射的光只要足够强，同样可以被看到，并表现为一个光点。
相同的道理，人眼的角分辨率只有1分左右，然而恒星的角直径可以小到1/1000秒以下，比人眼的角分辨率小了60000倍，但人眼还是能看到它——当然，它同样也只是表现为一个光点。
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