http://localhost/think/index.php/Index/index这一个是伪静态URL地址，为了使页面更好的被搜索引擎抓取。搜索引擎更偏好于静态页面，动态页面又一个特点就是有个?号，所以这样写就把它去掉了。
http://localhost/mythink/index.php?m=Index&a=index这一个是最原始的访问方法。典型的动态网页URL地址。对搜索引擎不友好。
http://localhost/think/index.php/Index/index?id=1这个是伪静态的兼容性写法。有的服务器不支持伪静态，所以这样写。
还有一种方式你没提出来：即http://localhost/think/index/Index/index。他是apache的rewrite功能，需要开启rewrite模块。但是有的服务器并没有开启，并且开启的话会增加服务器的资源消耗。
总结：你在伪静态后面可以添加.html或者.htm等静态页面的扩展名，把伪静态做的更加完美，TP框架有这样的功能，你研究下。
注：rewrite其实也是伪静态的一种。
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