清朝作为最后一个封建朝代，而皇后的地位亦是历朝最高的。
皇后别称中宫，在宫中称主子，妃嫔只是小主而已，意味皇后才是後宫之主，六宫统帅。每个月都有数天，或在重要日子如年三十至年初二，皇帝必须驾幸皇后寝宫，其他日子才能选绿头牌，召幸别的妃嫔。而且皇后可以陪伴一整晚，不需要像妃嫔那样，时间到了就会有太监駄走，意味皇后才是皇帝的正妻。
而祭祀亦是清宫皇后的重要职责。吃肉节、祭灶等都是由皇后主祭 (跟汉人男不拜月，女不祭灶不同)，而举行祭祀的地方就是坤宁宫。坤宁宫与乾清宫和交泰殿，合称后三宫，位在同一中轴缐上，不是皇后是不可以居在坤宁宫的。雍正之后的皇后都不住坤宁宫了，但仍是中宫象徵。清代入关后，将坤宁宫依满族传统改建了。里面有一个很大的灶头，作为祭祀用途。所谓“家有万事，主持一人”，寓意皇后才是这个皇家的女主人。另外皇后会率领妃嫔公主福晋等，参予亲蚕礼。对古时讲究男耕女织来说，这是相当重要的祭礼，以此表明皇后为天下织妇做出榜样。不过这是在乾隆时代才开始出现在清皇室的祭祀中。
皇后作为後宫主帅，在後宫有著绝对的权威。如果妃嫔犯了宫规，皇后可以用祖宗家法的名义申诫，甚至杖责妃嫔。皇后驾幸妃嫔寝宫，妃嫔接到通报后，就得在宫门外迎候，这与皇帝驾临是一样的。妃嫔每天早上起床，梳洗更衣后，就得到皇后寝宫中给皇后请安，侍候皇后梳洗。皇后亦可以与妃嫔闲话家常。当然像一般人家那样，亲亲热热的拉拉手说话是不可以的。平日后妃燕居所穿的便服，样式不会有太大分别，但一般妃嫔是不能穿戴明黄服饰，这是皇后才能穿用的。
此外，清代皇后还有一项独有的权利－－中宫笺奏。每逢元旦，千秋节(皇后生日)等重要节日，皇后都可以动用中宫笺奏去达成自己的心愿，一旦中宫笺奏明发，连皇帝谕旨都不能轻易驳斥，可说是皇后最大的权力象征。
顺治皇帝就曾经停止第二任皇后孝惠皇后的中宫笺奏权利，借此羞辱皇后，但在孝庄皇太后的干预下，很快就恢复了。