A、共同进化是指不同物种之间、生物与无机环境之间相互影响、不断进化，A错误；B、种群基因库是一个种群中全部个体所含有的全部基因，B正确；C、有些物种形成过程可以不经过地理隔离而直接出现生殖隔离，C错误；D、自然选择是选择具有有利基因的个体，不决定新基因产生，D错误．故选：B．
