公积金社保缴存额大于底薪是否合法

不合法的。
住房公积金的缴存方式：
职工和单位住房公积金的缴存比例均不得低于职工上一年度月平均工资的5%，不得高于12%；
有条件的城市，可以适当提高缴存比例；
具体缴存比例由住房公积金管理委员会拟订，经本级人民政府审核后，报省、自治区、直辖市人民政府批准；
城镇个体工商户、自由职业人员住房公积金的月缴存基数原则上按照缴存人上一年度月平均纳税收入计算；
单位逾期不缴或者少缴住房公积金的，由住房公积金管理中心责令限期缴存；
逾期仍不缴存的，可以申请人民法院强制执行。

社保和公积金都是按照员工工资的一定比例缴纳的，和底薪多少是没有直接关系的，是可以比底薪高的。

社保参保人月平均工资低于最低缴费基数的，按最低缴费基数计缴，月平均工资高于最低缴费基数的，按实际工资缴费，最高不超过300%。

社保缴费计算方法
一般以上一年度本人工资收入为缴费基数。
（1）职工工资收入高于当地上年度职工平均工资300%的，以当地上年度职工平均工资的300%为缴费基数；
（2）职工工资收入低于当地上一年职工平均工资60%的，以当地上一年职工平均工资的60%为缴费基数；
（3）职工工资在300%—60%之间的，按实申报。职工工资收入无法确定时，其缴费基数按当地劳动行政部门公布的当地上一年职工平均工资为缴费工资确定。
每年社保都会在固定的时间（3月或者7月，各地不同）核定基数，根据职工上年度的月平均工资申报新的基数，需要准备工资表这些证明。

公积金的缴存比例最高不得超过当地社平工资的12%。

《住房公积金管理条例》
第十六条
职工住房公积金的月缴存额为职工本人上一年度月平均工资乘以职工住房公积金缴存比例。
单位为职工缴存的住房公积金的月缴存额为职工本人上一年度月平均工资乘以单位住房公积金缴存比例。

第十七条
新参加工作的职工从参加工作的第二个月开始缴存住房公积金，月缴存额为职工本人当月工资乘以职工住房公积金缴存比例。
单位新调入的职工从调入单位发放工资之日起缴存住房公积金，月缴存额为职工本人当月工资乘以职工住房公积金缴存比例。

第十八条
职工和单位住房公积金的缴存比例均不得低于职工上一年度月平均工资的5%；有条件的城市，可以适当提高缴存比例。具体缴存比例由住房公积金管理委员会拟订，经本级人民政府审核后，报省、自治区、直辖市人民政府批准。

参保人月平均工资低于最低缴费基数的，按最低缴费基数计缴，月平均工资高于最低缴费基数的，按实际工资缴费，最高不超过300%。