那属于户籍管理部门工作失误所致,同时关于违规生育与户口登记无关。建议你与户籍管理部门交涉,赶紧解决问题才是关键。
当时的网络条件不好,肯定是你的户口在派出所登记了,但是没有联网保存到公安系统中,你可以找她事的派出所进行核实,出具证明,然后提交联网手续就好了。