可采用药物或（和）手术治疗（保守性或根治性）。迄今为止，除根治性手术外，尚无一种理想的根治方法。无论是药物治疗抑或保守性乎术均有相当高的复发率。因此，应根据患者年龄、症状、体征、病变范围以及对生育要求、患者的主观愿望等因素加以选择，强调个体化治疗。主张选对药物积极治疗并结合密切随访复查，注意卵巢囊肿的性质变化，再采取相应的对策。症状轻或无症状的轻微病变选用期待治疗；有生育要求的轻度患者明确诊断后先行药物治疗，病情重者行保留生育功能手术；年轻但无生育要求的重症患者可行保留卵巢功能手术，并辅以药物治疗；症状及病变均严重的无生育要求患者可行根治性手术。
手术方式有开腹手术和经腹腔镜手术两种。腹腔镜手术是本病最佳的处理方法。目前认为以腹腔镜确诊、手术+药物为内异症治疗的金标准。有条件的医院，腹腔镜手术应为内异症的首选治疗方法。但腹腔镜手术的选择及效果在很大程度取决于设备、器械和手术者的经验及技巧。开腹手术可用于腹腔镜条件不具备或非常复杂的手术，如严重粘连和有多次手术史者。
你好朋友，可以外敷方法---个有会贴。
巧克力囊肿是比较常见的妇科疾病，
妇科疾病是比较多的，
巧克力囊肿是妇科疾病里面比较棘手的，
一旦发现巧克力囊肿，就要及时处理。
也不要耽误拖延，如果耽误拖延，
可能会非常严重的，有可能会癌变的，
所以要及时处理。平常的饮食也要注意，
多吃一些清淡的食物，
不要吃辛辣的食物，不要吃辣椒之类的，
也不要吃一些海鲜类的发物。
平常要多注意锻炼身体，
提高自己的身体素质。
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