投资者进行港股通交易面临的存管结算风险主要包括三方面：（1）证券交收周期差异：港股通交收周期为T+2日。买入证券的相关权益需在交收后方可享有；（2）账户透支：投资者需缴纳证券组合费等，与内地证券市场费用扣收方式不同，可能会引起账户透支；（3）延迟交收：有可能因台风或黑色暴雨等发生延迟交收。香港结算因极端情况下需对中国结算实施现金结算的，中国结算将参照香港结算的处理原则对内地进行相应处理。
