第一种途径：渠道不同：
作者的出书有很好的市场前景，得到了出版社的赏识，向出版社投稿后，由出版社安排具体的出版过程，等走到申请书号程序后，直接由出版社安排。
第二种途径：反映不同：
大多数作者写的出书，是很难让出版社赚钱的，但又满足了基本的出版条例，只是发行销售上潜力欠佳。这样的书出版社会给予自费出书。自费出书的具体操作是在出版公司帮助下来完成。即个人与出版社的沟通，变成了出版公司，一方面与作者沟通，了解需求，告知出版的具体要求;另一方面与出版社合作完成出书的程序。即申请书号的步骤，由出版公司到出版社申请来完成。
第三种途径：自费不同：
作者对于自己的出书情况是了解的，该选择公费出书还是自费出书，是心中有数的。根据自己选择的出书方式，来决定通过什么途径到出版社申请书号。
参考资料来源：百度百科-横向课题
参考资料来源：百度百科-纵向课题
横向课题是相对于纵向课题而言。纵向是指国家、省、各个部布置的课题，由上而下，做课题的和发布课题的是领导与被领导的关系，所以叫纵向。
横向课题是指企业的课题，做课题的和企业是平等协商的合同关系。所以叫横向课题。因此横向课题是指各级政府及政府职能部门、企事业单位、社会团体等委托研究的课题 ( 已确认为国家级课题、省部级课题、校级课题的除外) ，包括科学研究类、技术攻关类、决策论证类、设计策划类、软件开发类等。横向课题是学校扩大对外联系，服务地方经济建设，提高科研水平和知名度的重要途径。
纵向课题是指有各级政府指定的科研行政单位代表政府立项的课题。如:国家科技部、省科技厅、市科技局，国家社科联、省社科联、市社科联，及教育部、教育厅等。于此相一致的概念，还有横向课题就是地方政府、企事业单位委托你做的课题，比如规划项目、技术改造之类的。
横向主要是指和企业合作
帮助企业解决生产难题的课题
纵向主要指的是一些专门用来做基础研究的课题
比如国家的、省里的自然基金
横向我的理解是应用性的课题，主要是已有成果在横向的扩展应用
而基础研究能推动学科向前发展，所以称为纵向课题
只是个人理解
不知道对不对
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