聚丙烯凝胶电泳（PAGE）适用于小片段（5~500bp），琼脂糖凝胶电泳适用的片段范围更大（200bp~50kb）；PAGE的分辨能力强于琼脂糖，可分辨1~10bp的碱基差异。TBE的缓冲能力比TAE大，所以，PAGE选用TBE做缓冲液（让小片段跑得慢）。琼脂糖凝胶电泳选用两种缓冲液都可以，但两种情况下最好选TAE：1)电泳片段大于13kb的片段，2)切胶回收DNA（因为TBE会与琼脂糖反映形成四羟基硼酸复合物降低DNA片段的回收率）
琼脂糖凝胶电泳是水平的，PAGE是垂直的（垂直的胶加样孔与电泳方向一致，可以加更多的样）
跑琼脂糖用TAE
跑PAGE用TBE
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