2018年2月23日凌晨一点多,
曲靖到上海南站的K740次列车,
正常情况下是24号的14:33分到达上海南站
通过体外无细胞系统翻译找出目的基因mRNA以后,变可进行cDNA第一链的合成,其步骤包括:
1)在Ependorf管中加50pmol/L的一种α32PdNTP和1mg/ml的mRNA 10μl(10μg),100m mol/L甲基氢氧化汞1μl,室温反应l0分钟,使RNA变性。
2)加100m mol/L的β-巯基乙醇2μl和10m mol/L RNA酶抑制剂2μl,室温放置5分钟。β-巯基乙醇有稳定逆转录酶活性的作用。
3)向上述反应混合物加lmg/ml的引物01igo dT(12~18聚体)10μl,1mol/L Tris.HCl(pH8.3)5μl,11mol/L KCl7μl,250m mol/L MgCl22μl,再加20 m mol/L的4种dNTP各2.5μl,逆转录酶2μl(40单位),用水补充到50μl,充分混匀,42℃反应1~3小时。
4)加0.5 EDTA(pH8.0)2μl终止反应,然后加150m mol/L NaOH 25μl,65℃反应1小时,或37℃8小时,水解mRNA模板,得到cDNA第一链,再加pH8.0,1m mol/L Tris.HCl,各25μl中和其pH。
5)测定放射活性,计算合成的DNA量。实际上,cDNA第一链的产量往往不会超过poltAmRNA用量的10%~30%。
6)用等体积的酚-氯仿抽提―次,取水相并用SephadexG-100离心柱层析(参看第6章)将cDNA同剩余的dNTP分开,以2.5倍体积的95%冷乙醇沉淀。
7)合成的cDNA第―链在1.4%的碱性琼脂糖凝胶上电泳,用末端标记的pBR322限制性片段为分子量标准,电泳后,铺X-光片,进行放射自显影,确定cDNA第一链的大小。
2:第二链的合成
a:第一链合成完毕后,直接进行第二链的合成。在第一链合成体系中分别加入
2.5×第二链缓冲液40μl,
DNA聚合酶Ⅰ23μ
RNase H 0.8μ
加水至100μl
b: 14-16℃下放置2小时。(>3Kb时反应时间延长至3-4小时)
c:70℃,10min,点动离心,置于冰浴
d: 在样品管中加入T4DNA聚合酶2μ,37放置10分钟。
e:加入4μl 500mM的EDTA到该样品管中,然后置于冰浴上.
f: 等体积加入酚\氯仿\异戊醇抽上清,12000g,3min。
g: 上清液转移至一干净试管,加2V乙醇,1/10V乙酸钠,-20℃30min沉淀,12000g,15min收集沉淀,70%乙醇洗沉淀,干燥,TE复溶。